查看原文
其他

“西城大爷”凭最强大脑为防疫立功!要把病毒揪出来,总共分几步?

冷哲 腾讯医典 2022-11-06


北京最近这波疫情的防控工作里,有一位“大功臣”,就是第一位被确诊的“西城大爷”唐某某。流行病学调查(以下简称“流调”)人员都称赞他记忆力惊人。


唐先生详细回顾了从5月底到被发现确诊这段时间里,自己的所有行程,甚至是接触过的每一个人的名字。尤其是提供了6月3日前往新发地市场购物的行程,连买了什么东西,在哪里买的,都能描述得清清楚楚。

(图片来源:北京日报)

正是这些细节,帮助流调人员在第一时间内,精准地找出了此次疫情的源头。

在腾讯医典6月17日发布的“病毒从哪儿来”一文中,我们对此次疫情的病毒来源进行了分析,并提出,病毒基因分析好比“亲子鉴定”(其实更准确的类比是“法医鉴定”),流行病学调查则类似于“警察破案”

那么,这两个工作在新冠病毒的溯源工作中,都起到了什么作用呢?


流调人员和实验室检测人员的关系,就相当于警察和法医这对“搭档”一样。

警察(流调人员)负责对证人(感染者或密切接触者)进行问话和调查,寻找破案线索(患者的行程轨迹、与他人的交集),努力找到真凶(病毒源头)

法医(技术人员)则根据案发现场(疫情暴发地,比如新发地市场)采集到的物证(患者的血液样本和环境采集样本)等等,运用技术手段(基因测序等)来为警察提供更多的破案线索。

两者缺一不可,只有通力合作,才能完成案件的侦破(找到疫情的源头)

(图片来源:人民日报)

综合目前的信息,此次疫情的病毒溯源工作,进行到了哪一步呢?


幸亏有“西城大爷”最强大脑的贡献,使得在案件侦破初期,就锁定了第一案发现场——新发地农贸市场海鲜大厅。

接下来法医的跟进,在案发现场找到了更多的受害者(被感染人员),同时找到了大量的物证(环境样本,比如切割三文鱼的案板)


而警察依据对更多受害者的调查和问询,确认了部分第二甚至第三案发现场(比如近期公布中、高风险地区),得出了一条分布北京多地的感染链。

法医通过实验室的分析,划分出了多个高中低风险区域,并在各个区域内进行进一步的摸排(比如北京部分地区正在组织的集体核酸检测),来寻找更多潜在的受害者。

(图片来源:北京日报)

通过对案情的分析,破案人员指出了凶手(新冠病毒)有两种可能的犯案手段:

1.通过一个感染者,在市场里传播了病毒,顺便牵连了无辜群众(比如被大家嫌弃的三文鱼)


2.也可能是通过冷链物资,从国外输送进来病毒,因为病毒在低温环境下可以生存很长时间,足够从遥远的地方来到国内。

法医在接下来的实验室检查中,通过对病毒的基因进行测序,发现受害人的病毒,并不是中国本土的病毒,而是与欧洲流行的病毒更为接近。而这一测序结果已经发布在国际科研领域的权威数据库[1]中,受到了国际的承认。

但由于在欧洲流行的病毒株,同时也在美国、俄罗斯等多个国家和地区被发现,因此,我们很难依靠这个证据来判断病毒的源头。

经过对测序结果的深度分析得知,在新发地找到的病毒还不是“同一批次”的病毒。相比现在欧洲流行的病毒株,这些病毒更古老,而且还互相不同[2]

依据上面这些实验室分析结果,我们又得出了一个新的推论:

这些病毒可能是通过远洋货轮,经过了漫长(1个月或几个月)的时间,从遥远的地方来到了中国。这样才能解释,为什么新发地发现的病毒比欧洲现在流行的病毒古老了很多。

同时,病毒可能在新发地默默潜伏了一段时间,已经发生了变异。


当然还有一种可能就是,病毒在跨过山和大海来到中国之前,并不是单一种类的病毒,冷冻品可能被多种接近的病毒污染,以至于达到中国后,就呈现出多种暴发的趋势。

以上就是北京这波疫情的病毒溯源最新进展

我们把病毒溯源的简化流程做了一张图,你可以直观看出警察和法医都在做什么。



法医(实验室检测人员)要进一步对更多的受害者和物证,进行深度的基因测序分析。

他们几乎一天24小时不眠不休地工作着,每天都有新发现。比如,6月18日国家微生物科学数据中心(NMDC)的数据库上才有3条测序结果,19日就已经增加到了8条。相信未来几天,这个数字会快速增加,为破案提供更多的技术支持。

而警察(流调人员)需要根据法医更新的线索,来寻找案情的真相。

(图片来源:北京日报)

如果法医在没有打开包装的冷冻物资内部发现了新冠病毒的踪迹,那么接下来,警察就需要追踪这批货物的来源与入境路线,看是否与实验室分析的结果一致。

比如说,这批物资来自A国,而所发现的病毒基因和A国流行的病毒基因一致,那基本就能锁定病毒的“国籍”了。

如果在冷冻物资的外包装上发现了病毒,就需要判断,病毒是在运输、冷冻等环节,还是在新发地市场内的某个环节上沾染到外包装的。

比如,也许是某个感染者打了个喷嚏,病毒就被沾染到了外包装上。

再比如,北京市疫情防控工作新闻发布会6月19日公布,在新发地的豆制品上也发现了新冠病毒,也许就是被殃及的池鱼呢?


当然,这一切还都是假设,还需要“警察”和“法医”齐心协力,进一步扩大受害者的摸排范围,调动全社会的力量,找出所有受害者,才能真正遏制这次疫情。


参考文献

[1]https://www.gisaid.org.

[2]http://Nextstrain.org.



主创团队


编辑:张杰、王艳 | 校对:胡磊

运营:郑敏群 | 排版:李永敏

统筹:叶正兴


喜欢医典,快来“点亮星标”

不再错过精彩内容

👇



往期推荐




您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存